8(812)644-63-17 – Приёмная Института
8(812)671-04-50 – Медицинский центр
RSS лента
Отправить обращение

Санкт-Петербургский НИИ эпидемиологии
и микробиологии имени Пастера

Руководство

Дедков Владимир Георгиевич


заместитель директора Института по научной работе

Владимир Георгиевич Дедков в 2008 г. окончил Московскую медицинскую академию им. И.М. Сеченова по специальности «Медико-профилактическое дело».

С 2006 по 2008 гг. работал младшим научным сотрудником отдела респираторных инфекций ФБУН Московский НИИ Эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н. Габричевского.

С 2008 г. работал младшим научным сотрудником, научным сотрудником, а затем старшим научным сотрудником ОМДиЭ ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора в научной группе Генной инженерии и биотехнологии.

В 2013 г. проходил стажировку в институте вирусологии Боннского университета (Германия). Целью стажировки являлось изучение подходов поиска новых патогенных микроорганизмов.

В 2014 г. по заданию руководства Роспотребнадзора разработал диагностическую систему в формате ОТ-ПЦР в реальном времени для диагностики вируса Эбола. Лично участвовал в апробации и авторском надзоре за работой сотрудников СПЭБ в очаге лихорадки Эбола в Гвинеи. 

В период 2014-2017 гг. неоднократно выезжал в длительные командировки для работы в составе СПЭБ и Российско-Гвинейского научного центра по изучению инфекционных заболеваний. Разработал диагностические системы в формате ОТ-ПЦР в реальном времени для выявления возбудителей филовирусных лихорадок. Оказывал организационно-методическую помощь сотрудникам СПЭБ и участвовал в обучении Гвинейских специалистов методам молекулярной диагностики.

В 2016 г. защитил диссертацию «Эпидемиологическая значимость вируса Кемерово на территории Российской Федерации» на соискание ученой степени кандидата медицинских наук по специальности «Эпидемиология».

С мая 2018 г. - заместитель директора по научной работе ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера.

Участник программного и редакционного комитета и Председатель секции «Особо опасные инфекции» Международной конференции «Молекулярные основы эпидемиологии, диагностики, профилактики и лечения актуальных инфекций».

Член Комитета по молекулярной диагностике инфекционных и неинфекционных заболеваний Ассоциации «Федерация лабораторной медицины».

Член экспертной комиссии при Президиуме совета по реализации Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий на 2019-2027 годы.

Член экспертного совета по здравоохранению при Межпарламентской Ассамблее стран СНГ.

Эксперт Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ) по расследованию возникновения эпидемии COVID-19.

Член международной экспертной группы ВОЗ по противодействию распространению опасных заболеваний (SAGO).

Областью научных интересов В.Г. Дедкова являются молекулярная диагностика особо опасных, природно-очаговых и трансмиссивных заболеваний человека и животных, эпидемиология и экология арбовирусов, разработка комплексных подходов диагностики редких и неизвестных возбудителей инфекционных заболеваний. 

Награды:

Медаль ордена «За заслуги перед Отечеством» 2-й степени за участие в ликвидации эпидемии лихорадки Эбола в р. Гвинея, орден Пирогова «За большой вклад в борьбу с коронавирусной инфекцией (COVID-19)», памятная медаль «100-летие Российского научно-исследовательского института Микроб».

Основные публикации:

  1. Dedkov VG, Magassouba N', Safonova MV, Naydenova EV, Ayginin AA, Soropogui B, Kourouma F, Camara AB, Camara J, Kritzkiy AA, Tuchkov IV, Shchelkanov MY, Maleev VV. Development and Evaluation of a One-Step Quantitative RT-PCR Assay for Detection of Lassa Virus.J Virol Methods. 2019; 271:113674. doi: 10.1016/j.jviromet.2019.113674
  2. 2. Kuleshov KV, Vodop'ianov SO, Dedkov VG, Markelov ML, Deviatkin AA, Kruglikov VD, Vodop'ianov AS, Pisanov RV, Mazrukho AB, Titova SV, Maleev VV, Shipulin GA. Travel-Associated Vibrio cholerae O1 El Tor, Russia. Emerg Infect Dis. 2016 Nov;22(11):2006-2008. doi: 10.3201/eid2211.151727.
  3. 3. V.G. Dedkov, A.N. Lukashev, A.A. Deviatkin,K.V. Kuleshov , M.V. Safonova, E.N. Poleshchuk, J.F. Drexler, G.A. Shipulin. Retrospective diagnosis of two rabies cases in humans using NGS. Journal of Clin. Virol.2016 Mar 14; 78:74-81. doi:.1016/j.jcv.2016.03.012.
  4. 4. Deviatkin A.A., Lukashev A.N., Poleshchuk E.M., Dedkov V.G., Tkachev S.E., Sidorov G.N., Karganova G.G., Galkina I.V., Shchelkanov M.Yu., Shipulin G.A. The phylodynamics of the rabies virus in the Russian Federation. PLoS One. 2017 Feb 22;12(2):e0171855. doi: 10.1371/journal.pone.0171855. eCollection 2017.
  5. 5. Anna M. Varizhuk, Timofei S. Zatsepin, Evgeny S. Belyaev, Yury I.Kostyukevich, Vladimir G. Dedkov, German A. Shipulin, Georgy V. Shpakovski, and Andrey V. Aralov. Synthesis of Oligonucleotides Containing Novel G-clamp Analog with C8-Tethered Group in Phenoxazine Ring: Implication to qPCR Detection of the Low-Copy Kemerovo Virus dsRNA. Bioorg Med Chem. 2017 Jul 15;25(14):3597-3605
  6. 6. Dedkov VG, Simonova EG, Beshlebova OV, Safonova MV, Stukolova OA, Verigina EV, Savinov GV, Karaseva IP, Blinova EA, Granitov VM, Arsenjeva IV, Shipulin GA. The burden of tick-borne diseases in the Altai region of Russia. Ticks Tick Borne Dis. 2017 Aug;8(5):787-794
  7. 7. Dedkov VG, Shchelkanov MY, Bushkieva BT, Rudenko TA, Kurdyukova OV, Galkina IV, Sapotsky MV, Blinova EA, Dzhambinov SD, Shipulin GA. A neonatal death associated with Crimean-Congo hemorrhagic fever (Republic of Kalmykia, Russia, June 2016).Antiviral Res. 2017 Sep 4;146:146-148
  8. 8. Dedkov VG, Magassouba NF, Safonova MV, Deviatkin AA, Dolgova AS, Pyankov OV, Sergeev AA, Utkin DV, Odinokov GN, Safronov VA, Agafonov AP, Maleev VV, Shipulin GA Development and evaluation of a real-time RT-PCR assay for the detection of Ebola virus (Zaire) during an Ebola outbreak in Guinea in 2014-2015. J Virol Methods. 2016 Feb;228:26-30.
  9. 9. Dedkov V.G., Deviatkin A.A., Poleshchuk Е.М., Safonova M.V., Blinova E.A., Shchelkanov M. Yu, Sidorov G.N., Simonova E.G., Shipulin G.A. Development and Evaluation of a RT-qPCR Assay for Fast and Sensitive Rabies Diagnosis. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease. September 2017. DOI: 10.1016/j.diagmicrobio.2017.09.009
  10. 10. Kiselev D, Matsvay A, Abramov I, Dedkov V, Shipulin G, Khafizov K. Current Trends in Diagnostics of Viral Infections of Unknown Etiology. Viruses. 2020 Feb 14;12(2):211. doi: 10.3390/v12020211.
  11. 11. Litov AG, Deviatkin AA, Goptar IA, Dedkov VG, Gmyl AP, Markelov ML, Shipulin GA, Karganova GG. Evaluation of the population heterogeneity of TBEV laboratory variants using high-throughput sequencing. J Gen Virol. 2018 Feb; 99(2):240-245. doi: 10.1099/jgv.0.001003.
  12. Safonova MV, Shchelkanov MY, Khafizov K, Matsvay AD, Ayginin AA, Dolgova AS, Shchelkanov EM, Pimkina EV, Speranskaya AS, Galkina IV, Dedkov VG. Sequencing and genetic characterization of two strains Paramushir virus obtained from the Tyuleniy Island in the Okhotsk Sea (2015). Ticks Tick Borne Dis. 2018 Nov 12 pii: S1877-959X(18)30345-5. doi: 10.1016/j.ttbdis.2018.11.004
  1. Ayginin AA, Pimkina EV, Matsvay AD, Speranskaya AS, Safonova MV, Blinova EA, Artyushin IV, Dedkov VG, Shipulin GA, Khafizov K. The Study of Viral RNA Diversity in Bird Samples Using De Novo Designed Multiplex Genus-Specific Primer Panels. Adv Virol. 2018 Aug 12;2018:3248285. doi: 10.1155/2018/3248285
  2. Dolgova AS, Safonova MV, Dedkov VG.Universal Library Preparation Protocol for Efficient High-Throughput Sequencing of Double-Stranded RNA Viruses. Methods Mol Biol. 2020;2063:181-188. doi: 10.1007/978-1-0716-0138-9_14
  3. E.V. Naidenova, K.S. Zakharov, M.Y. Kartashov, D.A. Agafonov, A.M. Senichkina, N’Faly Magassouba, I. Nourdine, A.A. Nassour, M.B. Bah, A. Kourouma, S. Boumbali, M.Y. Boiro, S.A. Scherbakova, V.V. Kutyrev, V.G. Dedkov, Prevalence of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus in rural areas of Guinea, Ticks and Tick-borne Diseases, Volume 11, Issue 5, 2020, https://doi.org/10.1016/j.ttbdis.2020.101475.

    16.Goncharova EA, Dedkov VG, Dolgova AS, Kassirov IS, Safonova MV, Voytsekhovskaya Y, Totolian AA. One-step quantitative RT-PCR assay with armored RNA controls for detection of SARS-CoV-2. J Med Virol. 2021 Mar;93(3):1694-1701. doi: 10.1002/jmv.26540

  1. Dedkov VG, Dolgova AS, Safonova MV, Samoilov AE, Belova OA, Kholodilov IS, Matsvay AD, Speranskaya AS, Khafizov K, Karganova GG. Isolation and characterization of Wad Medani virus obtained in the tuva Republic of Russia. Ticks Tick Borne Dis. 2021 Mar;12(2):101612. doi: 10.1016/j.ttbdis.2020.101612
  2. Gladkikh A, Dolgova A, Dedkov V, Sbarzaglia V, Kanaeva O, Popova A, Totolian A. Characterization of a Novel SARS-CoV-2 Genetic Variant with Distinct Spike Protein Mutations. Viruses. 2021 May 29;13(6):1029. doi: 10.3390/v13061029.
  3. Dedkov VG, Magassouba N, Stukolova OA, Savina VA, Camara J, Soropogui B, Safonova MV, Semizhon P, Platonov AE. Differential Laboratory Diagnosis of Acute Fever in Guinea: Preparedness for the Threat of Hemorrhagic Fevers. Int J Environ Res Public Health. 2021 Jun 3;18(11):6022. doi: 10.3390/ijerph18116022
  4. Koopmans M, Daszak P, Dedkov VG, Dwyer DE, Farag E, Fischer TK, Hayman DTS, Leendertz F, Maeda K, Nguyen-Viet H, Watson J. Origins of SARS-CoV-2: window is closing for key scientific studies. Nature. 2021 Aug;596(7873):482-485. doi: 10.1038/d41586-021-02263-6.
  5. Volynkina A, Lisitskaya Y, Kolosov A, Shaposhnikova L, Pisarenko S, Dedkov V, Dolgova A, Platonov A, Kulichenko A. Molecular epidemiology of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus in Russia. PLoS One. 2022 May 12;17(5):e0266177. doi: 10.1371/journal.pone.0266177.
  6. Gladkikh A, Dedkov V, Sharova A, Klyuchnikova E, Sbarzaglia V, Kanaeva O, Arbuzova T, Tsyganova N, Popova A, Ramsay E, Totolian A. Epidemiological Features of COVID-19 in Northwest Russia in 2021. Viruses. 2022 Apr 29;14(5):931. doi: 10.3390/v14050931.
  7. Dolgova AS, Safonova MV, Faye O, Dedkov VG. Current View on Genetic Relationships within the Bunyamwera Serological Group. Viruses. 2022 May 25;14(6):1135. doi: 10.3390/v14061135.
  8. Korobova ZR, Arsentieva NA, Liubimova NE, Dedkov VG, Gladkikh AS, Sharova AA, Chernykh EI, Kashchenko VA, Ratnikov VA, Gorelov VP, Stanevich OV, Kulikov AN, Pevtsov DE, Totolian AA. A Comparative Study of the Plasma Chemokine Profile in COVID-19 Patients Infected with Different SARS-CoV-2 Variants. Int J Mol Sci. 2022 Aug 13;23(16):9058. doi: 10.3390/ijms23169058.
  9. ladkikh A, Dedkov V, Sharova A, Klyuchnikova E, Sbarzaglia V, Arbuzova T, Forghani M, Ramsay E, Dolgova A, Shabalina A, Tsyganova N, Totolian A. Uninvited Guest: Arrival and Dissemination of Omicron Lineage SARS-CoV-2 in St. Petersburg, Russia. Microorganisms. 2022 Aug 20;10(8):1676. doi: 10.3390/microorganisms10081676.
  10. Bubnova L, Pavlova I, Terentieva M, Glazanova T, Belyaeva E, Sidorkevich S, Bashketova N, Chkhingeria I, Kozhemyakina M, Azarov D, Kuznetsova R, Ramsay ES, Gladkikh A, Sharova A, Dedkov V, Totolian A. HLA Genotypes in Patients with Infection Caused by Different Strains of SARS-CoV-2. Int J Environ Res Public Health. 2022 Oct 28;19(21):14024. doi: 10.3390/ijerph192114024.
  11. Korobova ZR, Arsentieva NA, Liubimova NE, Batsunov OK, Dedkov VG, Gladkikh AS, Sharova AA, Adish Z, Chernykh EI, Kaschenko VA, Ratnikov VA, Gorelov VP, Stanevich OV, Kulikov AN, Pevtsov DE, Totolian AA. Cytokine Profiling in Different SARS-CoV-2 Genetic Variants. Int J Mol Sci. 2022 Nov 16;23(22):14146. doi: 10.3390/ijms232214146.
  12. Gladkikh A, Klyuchnikova E, Pavlova P, Sbarzaglia V, Tsyganova N, Popova M, Arbuzova T, Sharova A, Ramsay E, Samoilov A, Dedkov V, Totolian A. Comparative Analysis of Library Preparation Approaches for SARS-CoV-2 Genome Sequencing on the Illumina MiSeq Platform. Int J Mol Sci. 2023 Jan 25;24(3):2374. doi: 10.3390/ijms24032374.
  13. Kirichenko A, Bryushkova E, Dedkov V, Dolgova A. A Novel DNAzyme-Based Fluorescent Biosensor for Detection of RNA-Containing Nipah Henipavirus. Biosensors (Basel). 2023 Feb 10;13(2):252. doi: 10.3390/bios13020252.
  14. Speranskaya AS, Artiushin IV, Samoilov AE, Korneenko EV, Khabudaev KV, Ilina EN, Yusefovich AP, Safonova MV, Dolgova AS, Gladkikh AS, Dedkov VG, Daszak P. Identification and Genetic Characterization of MERS-Related Coronavirus Isolated from Nathusius' Pipistrelle (Pipistrellus nathusii) near Zvenigorod (Moscow Region, Russia). Int J Environ Res Public Health. 2023 Feb 19;20(4):3702. doi: 10.3390/ijerph20043702.
  15. Mhamadi M, Dieng I, Dolgova AS, Touré CT, Ndiaye M, Diagne MM, Faye B, Gladkikh AS, Dedkov VG, Sall AA, Faye O, Faye O. Whole Genome Sequencing Analysis of African Orthobunyavirus Isolates Reveals Naturally Interspecies Segments Recombinations between Bunyamwera and Ngari Viruses. Viruses. 2023 Feb 16;15(2):550. doi: 10.3390/v15020550.
  16. Karas BY, Sitnikova VE, Nosenko TN, Dedkov VG, Arsentieva NA, Gavrilenko NV, Moiseev IS, Totolian AA, Kajava AV, Uspenskaya MV. ATR-FTIR spectrum analysis of plasma samples for rapid identification of recovered COVID-19 individuals. J Biophotonics. 2023 Jul;16(7):e202200166. doi: 10.1002/jbio.202200166.
  17. Badji A, Ndiaye M, Gaye A, Dieng I, Ndiaye EH, Dolgova AS, Mhamadi M, Diouf B, Dia I, Dedkov VG, Faye O, Diallo M. Detection of Crimean-Congo Haemorrhagic Fever Virus from Livestock Ticks in Northern, Central and Southern Senegal in 2021. Trop Med Infect Dis. 2023 Jun 12;8(6):317. doi: 10.3390/tropicalmed8060317.