В журнале International Journal of Molecular Sciences (MDPI) вышла статья «Whole-Genome Sequencing of an Inborn Errors of Immunity Cohort from Northwestern Russia Reveals Monogenic Causes and Rare Variant Patterns in CVID-Like Phenotypes», подготовленная в соавторстве с учёными Санкт-Петербургского НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера: Тихоном Савиным, Анной Седых, Юлией Останковой, Раисой Кузнецовой, Анной Чернышовой, Анжеликой Миличкиной и Арегом Тотоляном.
Работа посвящена генетическому анализу врожденных ошибок иммунитета - группы наследственных заболеваний, вызванных дефектами генов, которые отвечают за развитие и функционирование иммунной системы. В исследовании были проанализированы данные полногеномного секвенирования 72 пациентов из Санкт-Петербурга и Северо-Западного региона России, в том числе 42 пациентов с общей вариабельной иммунной недостаточностью (CVID) и CVID-подобными фенотипами.
У 14 пациентов (19%) были выявлены патогенные и вероятно патогенные варианты в генах BTK, CYBB, CHD7, AIRE, ATM, SBDS, NFKB1 и CTLA4, что позволило уточнить или подтвердить клинический диагноз. Еще у шести пациентов обнаружены варианты неопределенного значения, которые могут быть связаны с наблюдаемыми клиническими проявлениями. В подгруппе пациентов с CVID-подобными фенотипами дополнительно проведен анализ редких вариантов на уровне сигнальных путей, который выявил закономерности, ассоциированные с клиническими проявлениями заболевания, в частности, обогащение путей ответа на повреждения ДНК у пациентов с аутоиммунными осложнениями и модулей иммунной сигнализации у пациентов с поликлональной лимфоцитарной инфильтрацией.
Полученные результаты расширяют генетическую характеристику недостаточно изученной региональной когорты пациентов с врожденными ошибками иммунитета и демонстрируют ценность полногеномного секвенирования для молекулярной диагностики этих заболеваний.
